Сюжет ленты развивается после событий фильма «Мстители: Эра Альтрона» (Avengers: Age of Ultron). После ужасающей битвы Мстителей с Альтроном, правительство Соединённых Штатов приняло закон об обязательной регистрации, что заставит всех супергероев раскрыть свои личности и работать только на правительство.
В связи с этим происходит раскол среди самих супергероев: команда во главе с Железным Человеком (Тони Старком) выступает за регистрацию, во главе с Капитаном Америка (Стивом Роджерсом) – против. Можно только представить себе, к каким последствиям приведёт конфликт супергеройского масштаба.
Размытые границы между добром и злом, открытие новых граней в характерах тех персонажей, которые уже давно известны зрительской аудитории, придают особую новизну этому кинопроекту. Кроме того, замена привычного зрителю состава Мстителей откроет новые перспективы для продвижения новых членов команды. По слухам, в киноленте мы также сможем увидеть героев из второй части истории: Баки Барнса (Bucky Barnes) / Зимнего солдата (Winter Soldier), Брока Рамлоу (Brock Rumlow) / Кроссбоунса (Crossbones), а также Сэма Уилсона (Sam Wilson) / Сокола (Falcon).